予期せぬ事態が発生した。セントアークの敵司令部壊滅を確認したのも束の間、ノースポイントに司令要塞「イントレランス」の存在が判明。切り札の大型巡航ミサイルを失った今、これが敵の最後の砦であると思われる。ここを攻撃し、クーデター軍を殲滅するのが最後の任務だ。

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　最初に出現している必須ターゲットは、POW.PLANT×4、FORTRESS×4。ただし難易度HARDでは、POW.PLANTの代わりにTANKが配備され、より苛烈な攻撃を行ってくると同時に、TANKの周りにはN.TGT（黄）も置かれている。そのほかF-15S、そしてライバル機ADF-01 Z.O.E.が出現。F-15Sは撃墜しても新たに出現するため、殲滅は不可能。スコア稼ぎが目的でないなら、無視するのが一番。Z.O.E.は勲章コンプリートのために、是が非でも撃墜したいが、高い機動性に加えて後方にミサイルを放つ強敵。アラートがなったら上下に回避する準備をしておこう。

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　地上の目標を全て破壊すると、イントレランス要塞内部にあるSLBMを直接叩かなくてはならない。ただし地熱プラント基地攻撃ミッション「VISITING HOURS」のように時間制限はないので、気持ちにゆとりを持てるだろう。まずはF-15Sを要塞から切り離すべく、一旦ここから距離を取ろう。要塞内部の進入口を確認したら、F-15Sに接近されないように一気にアプローチし、中に侵入。通路は真っすぐなので、そのままゆっくり飛行し、中にあるSLBMを破壊すれば無事クリア。真のエンディングを観ることができる。