SECRET

同じアカウントで全5つのエンディングを見ると、ミッションを自由に選んでプレイできる「ミッションシミュレーター」がアンロックされる。ストーリーでは制約があったプレイアブル機体が、一部を除き自由に選ぶことが可能。

アカウントのセーブデータをロードし、タイトル画面に戻ると各ミッションの達成度が確認できる。画面上の四角いマスが各ミッションを表しており、達成度Aランクはピンク、Bランクはオレンジ、Cランクは黄色、Dランクは青を示している。

全ミッションをクリアすると、達成度に応じてミッションシミュレーターで使用可能な機体が増える。

・全Dランク以上：F/A-18I、F-16XAのゼネラルスキン、R-101、R-201のニューコムスキン、F-15S/MT、F-22Cのディジョンスキン、Su-37のレナスキン、R-102、R-103、R-311のシンシアスキン。

・全Cランク以上：UI-4054

・全Bランク以上：XR-900

・全Aランク：全機体でO.S.L.（衛星軌道レーザー）が使用可能。

別売りの「DIRECT AUDIO with AppenDisc」を購入するとX-49が使用可能となる。

機体と兵装の選択後に出てくるロード中、以下のコマンドを押し続けると兵装を変更できる。

〇＋START：投下型ボム

×＋START：プラズマビーム

△＋START：O.S.L.

□＋START：対地対空用スプレッドボム