ゼネラルリソースが、コモナ諸島にあるニューコムの宇宙開発基地に対し、攻撃を開始した。ロケット発射準備の隙を突く作戦と思われる。UPEOは、ニューコムの要請を受け同基地の防衛に当たることになった。今回はゼネラルの侵攻を阻止するのが任務である。

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　ゼネラルリソースは、ANTLIONという地上兵器を空中から投下する。まずは計10機のANTLIONが地上に到達する前に撃破を目指そう。地上に降りるとロケット発射口に向かい、そこに到達するとミッション失敗になる。ほかにもF/A-32Cが3機、C-17Bが1機出現しているが、何よりもANTLIONを優先して狙おう。以前の訓練とは異なり、ミサイルのロックオンが可能なのでさほど難しくはないはずだ。

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　ANTLIONを全滅させるとミッションアップデート。増援のF/A-32C×3機（赤TGT）を全て撃墜すればクリアとなる。なお、達成度Aランクを獲得するには18機の敵機（ANTLION含む）を撃墜しなければならない。逆算すると、赤TGT以外に最低5機のターゲットを墜とす必要がある。2次ミッションは時間にゆとりがあるので、落ち着いて片付けていきたい。